任天堂在公布Switch 2主机时表示，新主机将兼容大部分现有的Switch游戏，包括实体和数字版。然而，任天堂也发出警告，由于硬件变化，并非每款Switch游戏都能在Switch 2上完全运行，如Switch的Labo系列游戏可能因形状差异而无法在新主机上使用。

此外，如果Switch 2的Joy-Con手柄不具备前代右侧手柄的红外摄像头功能，那么依赖这一功能的游戏也将无法在新主机上运行。其他使用专属外设的游戏也可能面临兼容性问题，这些细节可能会在后续公布。类似限制在其他向下兼容的游戏主机上也曾出现。